Cette rue est située dans un secteur montagneux - anciennement, Notre-Dame-des-Laurentides - qui n'est pas sans rappeler un paysage de Suisse, d'où le nom emprunté à une ville de ce pays. Berne, capitale de la Confédération helvétique, est fondée en 1191 par le duc Berchtold V de Zãhringen et entre dans la Confédération en 1353. Cette cité militaire très puissante, qui étend sa domination sur une grande partie du pays suisse, adhère à la doctrine protestante dès 1528. En 1798, l'armée révolutionnaire française pille la ville et s'empare de plusieurs de ses territoires. Mais Berne reprend le pouvoir en 1814, pour devenir la capitale fédérale de la Suisse en 1848. Dès ce moment, sa croissance démographique s'accélère. La ville contemporaine, tournée avant tout vers les fonctions administratives, est une importante place bancaire et le siège de plusieurs organisations internationales. Le site pittoresque qu'elle occupe sur un méandre de l'Aar, l'architecture particulière des maisons, les vieux remparts transformés en promenade et le tracé des rues resté intact depuis le 12e siècle sont quelques-unes des caractéristiques qui lui permettent de figurer parmi les villes du patrimoine mondial.

Ancien toponyme
La rue de Berne portait auparavant le nom de rue Desnoyers, d'origine inconnue, lequel était déjà en usage lorsqu'il a été officialisé le 7 juin 1996. Ce toponyme a été remplacé car il existait, dans un autre quartier de Charlesbourg, un toponyme semblable.